2015年農委會公布台灣農耕地有80萬公頃，但農試所最近完成的「農地資源盤查」卻發現，真正用於生產的耕地只剩57萬公頃，三成耕地被占用，並衍生出農地污染問題。這份報告不只曝露農地危機，而且過去以耕地面積所計算的種植面積、產量、糧食自給率也變得不可信。所謂農地保護已淪為空談。
資料顯示，全國法定農地有277萬公頃，其中平地62萬公頃、山坡地215萬公頃，農耕地80萬公頃，但實際供糧食生產的農地只有57.6萬公頃，包括：農糧作物 52.1萬公頃、養殖魚塭 4.4萬公頃、畜牧使用 1.1萬公頃。
而目前沒被占用、但長期廢耕的耕地有10.5萬公頃，未來如果能調整灌排設施，農民也有種植意願，有機會恢復生產，這部分視為「潛在耕地」。
這份農地盤查是由農委會農試所組長郭鴻裕團隊，投入龐大的人力，近一年時間才完成，揭露農地的使用狀況。有別於過去的現地統計，這次盤查結合空照圖、現勘、並將各種資訊交互比對，更精準呈現以下的農地問題。
一、耕地計算不精準，連帶許多政策都錯了
資料顯示耕地占用問題嚴重，平地、山坡地宜農牧地總計13萬公頃被占用，其中平地6.7萬公頃、山坡地6.3萬公頃。占用理由各式各樣，包括工廠、農舍、住宅、商場等等，其中非法工廠就占了1.3萬公頃，比例最高。
耕地減少這麼多，直接衝擊糧食安全。農委會對外發布的糧食自給率是31%，那是以80萬公頃的可耕地為計算基礎，如果依這次盤查實際耕地少了三成，糧食自給率恐怕只剩兩成多而已。而一旦糧食自給率低，需倚賴更多進口食物，容易受國際物價波動影響，引發社會問題、甚至國安危機。
而耕地計算不精準，連帶許多政策也做得不精準。舉例來說，過去遇到缺水需要休耕時，不同單位計算的休耕面積出入極大。而負責土壤污染整治的環保署，接到通報去調查時，經常發現那塊污染的農地早已廢耕，但因為地目是農地，沒辦法還是要整治到符合農地管制標準，花了不少冤枉錢。
另外還有水資源的分配跟計算，一直以來官方都告訴我們，農業用水占七成，是用水量的大宗，但真的是這樣嗎？在耕地占用這麼嚴重的情況下，用水量都不用精確計算一下嗎？這樣水資源的政策又怎麼可能做得精準。
二、農地重金屬污染嚴重，約1千公頃受污染
農地占用不只是讓農耕面積減少而已，而且農地上的工廠、農舍排放的污水、廢棄物、燃燒排煙及落塵，以鄰為壑污染周遭農地。
這次盤查所做的「土壤重金屬污染風險分析」，以6.25公頃(250公尺X 250公尺)抽一點的方式，調查六種重金屬是否超過環保署土壤污染管制標準(食用作物)，結果有1,041點超標，換算下來，約6,500公頃農地可能遭受污染，這之中確認污染的農地約占16%，也就是1千公頃左右。
