搭配108課綱的「學習歷程檔案」，前身是「備審資料」，在多年的實施中產生不少問題，譬如說學生趕在高三下學期急就章準備，迎合升學招生的作用極強，這過程難免就會出現一些虛假偽造、砸大錢給廠商專業處理等情事，導致教育意義匱乏，也衍生傷害教育機會均等的問題。
「學習歷程檔案」規劃的原意正是要解決「備審資料」的弊病，因此希望學生在「每個學期」都能夠按部就班將課程中真實的學習歷程和成果加以整理，經過教師認證確實是學生本人親自完成的成果後，即可上傳存檔。為避免引發學生之間的「過度軍備競賽」，耗費心思與金錢在檔案的專業美工上，還在檔案容量上做出嚴苛的限制，直到2020年底才終於「從善如流」，加大容量。總而言之，在教育部的定位上，「學習歷程檔案」應該是先具有學習的教育意義，然後才可能有助於升學機會的爭取。
然而，一如既往，許多立意良善的教育改革措施一旦實施，尤其跟升學目標不免掛勾之後，就會出現許多困頓。
被視為升學工具
首先，不少搞不清楚「學習歷程檔案」意義的學校，直接以中央集權的心態、論件計次的數字管理，一體要求學生全部運用自主學習時間投稿小論文，導致許多學生的學習過程既無法自主安排，還充滿困頓，甚至自生自滅。
這些急功近利的校長、教師，還有著急的家長，雖重視「學習歷程檔案」，卻只是將其視為升學工具，不管學生的性向、能力與興趣，在沒有指導或不知如何指導的情形下壓迫學生投稿小論文，這已經產生嚴重的問題。2020年，高中生投稿到教育部「中學生網站」的小論文總計1萬5千多件，被評定為「抄襲」的比率約為3%，但這些遭辨識出來的虛假稿件可能只是冰山一角，也不是2020年獨有的現象。最近幾年來，甚至有逃過檢核，還順利獲獎，之後才遭到檢舉的多起案例，以致承辦單位後來不得不在公布成績前，特別針對得獎作品再次檢核，也果真抓到一些漏網之魚。功利心態扭曲了教育目的及學習活動，這是學習歷程檔案難免「困頓」的第1個原因。
大學端審核問題
學習歷程檔案難免「困頓」的第2個原因，來自大學端。
過去幾年不時傳出大學端審查備審資料未必都很確實，有些校系基於招生現實的各種盤算，在實施書審或面試時自有「實作智慧」與秘技，譬如將備審資料晾在一旁，直接分析學生考試成績、家世背景或居住區域，或者考腦筋急轉彎的問題，測驗臨場反應能力，或者故意威嚇考生，藉以檢核應試者的真正實力等，從評量專業的角度來看，這些方法的信度和效度是否能夠穩定建立，未必是教授們的考量，甚至教授們根本不具備這樣的專業知能。假如大學端對於備審資料確實有所疑慮，而別有評審創意與獨特心法，面對教育部改革備審資料而推出的學習歷程檔案，上述態度是否會固守不變呢？
