國務機要費到底是不是「等同特別費」？首長特別費的「大水庫理論」能不能用在國務機要費上？當年即已討論盈庭，簡單講，「大水庫」的成立要件，一是金錢來自特別費，二是支出來自當事人的財產，三是支出符合特別費用途（犒勞或公益可以，買尿片名牌包不行），四是支出必須大於或等於收入；陳水扁既主張 「大水庫」就要證明錢出自自己的帳戶，比方說，陳水扁為了拍公益宣傳片從國務機要費領了一千萬，再從自己的帳戶支出一千萬，那應該符合大水庫，但法庭調查宣傳片是從國務機要費以單據核銷，陳水扁若主張大水庫，豈不是他先領一千萬再報一千萬？包括他拿錢給親信馬永成林錦昌，或王丹、施明德等人，他也得證明錢出自他的財產，而非左手報國務機要費，右手取得企業贊助，否則就無法主張大水庫成立。
如此逐筆證明的程序，當年法庭早就為之，否則判決書不可能厚厚一大冊，連發票來自何人都幾無遺漏。如今陳水扁重提當年主張，不是不行，但還是要經過法庭程序，重新逐筆查驗，而法官心證之改變，或法條適用之轉移，都不可能靠庭外陳述達成。
除罪是除經辦人員罪，而非貪汙之罪
感慨之五，民進黨立法院總召柯建銘強調，國務機要費除罪化的工程一定要在會期內完成，理由是「特別費都除罪，為什麼國務機要費不能除罪」？特別費除罪是除二００七年之前會計等經辦人員便宜行事之罪，不是除首長濫用或濫報之罪，在二００七年之後若有首長不依特別費支用規定，亂執發票或收據，經辦人員還是要說「不」，否則依然要追究罪責；國務機要費就算要一併除罪，也是除經辦人員之罪，而非陳水扁之罪（若違法）。
陳水扁強調他不是歪哥貪汙之人，並以他就任總統就關掉了「國安秘帳」，包括奉天、當陽專案等，或許這是可信之言，畢竟他除了關掉「國安秘帳」之外，還為國務機要費設下單據或領據核銷的規定，他為自己設下了一個避免誘惑的較高門檻，遺憾的是，權力即使不令人腐化，却給人方便，雖然夫人到處為他搜集發票，其實也不容易，而來自企業的資助更是源源不絕，從現金到珠寶，不像現在政治獻金何時可以開戶何時必須關帳，法律都有明文規定。
做為卸任元首，牢也坐了，却仍困頓於十六年前的舊案，還時不時要面對「保外就醫」是真病還是裝病的質疑，確實難堪，但他不能不面對一個事實：有罪爭取特赦，前提是法庭判決有罪定讞，綿綿無絕期的停審，只能讓他綿綿無絕期的一再保外就醫；無罪爭取清白，前提還是法庭攻防見真章，庭外記者會給不了他清白，陳水扁要做的是回到法庭，為自己爭回失去久矣的尊嚴。
