其次則是衡陽與桂林陷落後，雖然從成都起飛的B-29戰略轟炸機只能威脅到日本九州，但同一時間塞班島、天寧島與關島為美軍所攻佔。從馬里亞納群島起飛的B-29仍能對日本本州施以轟炸，拿下衡陽與桂林根本毫無意義。而日軍在衡陽戰場上遭到方先覺部隊長達47天的頑強抵抗後，對是否要將「一號作戰」推行下去也展開了激烈討論。
考量到美軍隨時可能對菲律賓、台灣乃至於日本本土發動登陸作戰，大本營考慮停止「一號作戰」，將所有資源與人力投入到防衛絕對國防圈的「捷號作戰」之中。支那派遣軍總司令官岡村寧次大將堅決反對終止「一號作戰」，因為他手下的部隊天天遭受第14航空軍和中美空軍混合團的飛機炸射，自然是欲將中國戰場上所有的飛行基地除之而後快。
可日軍大本營的參謀本部第一部部長真田穰一郎少將，還有他手下的作戰課課長服部卓四郎大佐同樣也堅持把「一號作戰」打下去。身為「一號作戰」的策劃者，兩人制定「一號作戰」並且希望將「一號作戰」打到底的目的顯然與岡村寧次的純軍事考量不同，顯然有更深遠的政治動機，那就是為國民政府在戰後被中共推翻埋下伏筆。
為何非要推翻國府？
事實上到了1944年，就算是再狂熱的日本軍國主義者內心也知道日本在這場與美國的戰爭中取勝機率微乎其微，哪怕是服部卓四郎這樣的少壯派軍人也不是為了改變戰爭結局才發起「一號作戰」的。如果他還真的想要打敗美國，挽救大日本帝國的可悲下場，就更應該支持打「捷號作戰」才對。所以日本能否贏得戰爭，此時此刻已非服部卓四郎的首要考量。
不要說擊敗美國，服部卓四郎甚至不認為日軍有能力推翻蔣中正政權，他十分明白日本在多數中國人心中的形象除了侵略者外再無其他。抗戰爆發之初各種對中國平民的無差別屠殺，已經讓日軍無法在這場對抗美利堅的戰爭中驅使中華民族主義為己所用，只能期待壯大中的中國共產黨能再戰爭結束後代替自己完成推翻蔣中正的使命。
所以「一號作戰」發起的目的不是為了推翻蔣中正，而是試圖從政治上、外交上、軍事上、內政上、經濟上與文化上全方面削弱國民政府的影響力，為中國共產黨的戰後奪權鋪路。這也是為什麼「一號作戰」雖然有誤導蔣中正判斷日軍將向重慶發動進攻的內容，卻沒有真正向重慶發起進攻的計劃，因為服部卓四郎知道推翻蔣中正完全可以「成功不必在我」。
換言之「一號作戰」是一場日軍針對重慶國民政府發動的總體戰，或者超限戰，目的就是要幫助中共在戰後奪權。那麼又是什麼原因，導致服部卓四郎等日軍少壯派非要推翻國民政府不可呢？難道日軍不是以反共為名發動侵華戰爭嗎？為什麼極右翼的日軍能跨越意識形態的鴻溝，轉而幫助極左翼的中國共產黨推翻蔣中正呢？
