1961年初，美國新總統甘迺迪上任後，國務院希望根據國家繼承理論，讓聯合國將兩岸視為中國的「兩個繼承國」，而不討論那一方代表「中國」，從而都成為聯合國會員國。[1] 可是，臺美就聯合國代表權問題的交涉，因外蒙入會案節外生枝。[2] 蔣介石為阻止蒙古人民共和國成為聯合國的會員國，要在安理會動用否決權，造成臺美關係空前緊張。最後關頭，臺美妥協，甘迺迪放棄推動「兩個中國」的企圖，蔣介石不否決外蒙入聯。外蒙入會案，是1960年代一場重要的外交戰，穩定了此後十年的臺美基本關係，卻也使臺灣錯失以「兩個中國」並存於聯合國來根本解決兩岸關係的機會。
1946年1月5日，根據《中蘇友好同盟條約》，中華民國承認蒙古人民共和國獨立。1953年2月23日，中華民國宣布《中蘇友好同盟條約》失效，撤銷承認外蒙古的獨立。1955年12月13日，中華民國駐聯合國代表蔣廷黼在安理會對外蒙入聯申請行使否決權，主張全蒙古是中國的一部分。這是中華民國在安理會僅有的一次行使否決權。[3] 1961年4月，外蒙古和非洲法語區茅利塔尼亞申請加入聯合國，外蒙入會案再次浮上臺面。這次，蘇聯將外蒙古和茅利塔尼亞捆綁在一起，威脅說中華民國如否決外蒙，蘇聯就將否決茅利塔尼亞入會。5月初，非洲12個法語國家一致決議，倘國府否決外蒙因而妨礙茅國入會，則12國將一致與中華民國絕交，並反對中華民國的聯合國代表權。
4月28日，美國駐臺大使莊萊德告知外交部長沈昌煥，外蒙入會案提交安理會討論時，美國將棄權，並分洽各國棄權，美方估計該案無法在安理會獲得7票多數。[4] 4月30日，蔣介石自記「外蒙參加聯合國提案，美態度始終曖昧不明，其代表史丁文生誘勸我棄權不投反對票，而蔣廷黼竟信之不疑，可嘆。」[5]
5月初，蔣廷黻返國磋商，指出「對外蒙古入會我若使用否決權，則反感大；若棄權，則反感小。將來使用否決權所招致之反感，可能對我代表權有不利之影響，我不可不考慮：代表權要緊？抑外蒙古要緊？」[6] 蔣介石連續兩次接見蔣廷黻後，5月12日，沈昌煥正式告知莊萊德：外蒙案如在安理會獲7票多數，中國必予否決；如確不足7票，可考慮准由蔣廷黻代表酌情棄權。[7]
當時，為消除國府對中國代表權的疑慮，美國副總統詹森銜甘迺迪之命，於5月14日、15日訪問臺北，和蔣介石先後舉行三次會談，強調美國對中華民國在聯合國地位的支持，但未詳談外蒙入會案。[8] 5月23日，國務卿魯斯克向甘迺迪建議，給予外蒙古外交承認，互換使節，得到甘的同意。[9] 6月8日，國務院公開證實美國與外蒙古談判建交。蔣介石認為「此其動向乃對我國主權於不顧，豈不等於又一次出賣我國乎？...... 其有意侮辱我政府，不勝痛憤，乃命沈部長正式加以斥責。」[10]
