被認為接近「歷年最強等級」的今年第10號颱風珊珊登陸日本後，在九州一帶造成嚴重災情。儘管珊珊的威力持續減弱，日本氣象廳也預測9月1日之前可能轉為熱帶低氣壓，但其影響仍在持續。根據日本放送協會（NHK）的災情統計，截至8月30日上午10時，珊珊颱風已造成4人死亡、96人受傷及1人下落不明，超過百人傷亡。
珊珊颱風為日本多個地區帶來破紀錄的降雨量：關東地方南部從29日晚開始降下大雨，神奈川縣小田原市到30日8時50分的24小時累計雨量高達314.5毫米，相當於當地往年8月整月雨量的1.8倍；東海地方的情況更為嚴峻，靜岡市截至30日5時40分的72小時累計雨量達到515.5毫米，更是往年8月整月雨量的2.7倍之多。
珊珊帶來的破紀錄雨量導致許多地區出現嚴重淹水，以神奈川縣平塚市為例，當地已發生市區道路淹水、民宅泡水等情況。日本的陸空交通也被珊珊嚴重打亂：在鐵路方面，東海道新幹線30日從首班車起全線停駛，雖然名古屋站到新大阪站區間已在上午10時左右恢復行駛，但東京站到名古屋站區間仍維持全天停駛。
由於東海道新幹線停駛，許多旅客轉搭北陸新幹線，JR東日本因應乘客增加，在30日下午加開東京站到敦賀站的臨時列車。為了解決無法抵達目的地旅客的住宿問題，東海道新幹線從29日晚到30日晨特別提供了「列車飯店」服務，讓約700名旅客在列車上過夜。此外，九州新幹線和西九州新幹線今天也全線停駛，山陽新幹線的部分區間停駛或減班行駛。
在航空交通方面，日航（Japan Airlines）和全日空（All Nippon Airways）分別取消了287個和346個國內線航班。其他如捷星日本航空、天馬航空及空之子航空等公司也取消了部分航班。這種大規模的航班取消情況可能會持續到31日，日航和全日空已決定在31日分別取消9個和33個國內線航班。
