普悠瑪事故後，外界似乎才開始看到、也正視台鐵的體質、制度性等問題，政府在調查普悠瑪事故的原因的同時，也該對台鐵作全面體檢，投入資源、切割台鐵讓台鐵公司化，才能改變提升台鐵的體質、創造較佳的制度環境，台鐵才能浴火重生。
台鐵是一個公營單位，本質上就是容易出現一般公營單位的問題─彈性與效率低、冗員多、得過且過、法令束縛、政治干擾…..，而這些問題在不同時期，又會因環境變化而出現不同問題。
如早期台鐵是金飯碗時期，確實是冗員充斥；但在連年虧損、追求降低成本與虧損壓力下，現在較嚴重的問題反而是人員不足、難以吸引優秀新血加入；這由台鐵員工人數高峰時2.3萬人，數十年下來，運量從每年1億初頭人次增為2億人次，但員工數反而大降到1.4萬，列車剩下一名司機挑大樑，事故後才趕忙要增為2名司機，由此即可看出台鐵「減過頭」的問題。但台鐵現在景況則是：即使召募到新血，也缺乏留才誘因，離職率偏高。
因此要讓台鐵浴火重生，就必須先解決本質與體制的問題，第一步要作的應該就是先公司化─類似當年台灣的電信局透過所謂「電信三法」的修訂與訂定，讓電信局改制為中華電信公司，然後才有之後的釋股、民營化。台鐵未必能夠、或必須走到民營化這步，但公司化卻有其必要。
因為透過公司化的過程，可以把台鐵的過去、現在、與未來作一次釐清與切割；例如累積虧損，是否就該由政府承接，否則台鐵根本不可能公司化？擁有豐富資產的台鐵，散布在全省各地的場站土地也可一次作清理；台鐵虧損的主因在人事成本過高，其中的退撫支出是否就該切割出去，由政府負責？
以金融界的術語而言，類似金融機構逾放、負債過高難以存續時，把不良資產切割出去處理─即所謂把銀行分成「好銀行」、「壞銀行」；切割台鐵就是要把台鐵切割分為「好台鐵」與「壞台鐵」，讓「好台鐵」能重拾活力、成為有獲利、安全且能永續經營可能的公司，這種公司才有能力召募並留下足夠的新血與人才，公司經營才能上軌道並進入良性循環。
事實上，台鐵當然是一個「應該賺錢」的單位；早期獨占西部走廊中長程運輸的景況雖然不再，但與公路（兩條南北高速公路）、高鐵一起算是擁有寡占能力，旅客人次是成長而非衰退，甚至某些路線時常是一票難求；身為一家百年老店，台鐵各地資產其實非常豐厚，只是因公營單位束縛而難以發揮效益。甚至以目前台鐵的財務情況看，每年虧損25億元左右，坦白說，這個虧損數字並不致命，因為台鐵的需求長期存在甚至成長中，不會如某些虧損企業，其產品的需求是快速減少甚至消失。
