談及印尼族群政治，不能不提印尼華人社會的處境，台灣與其他華人社會應會對此課題感興趣。印尼華人數量只佔全國人口2-3%（這個數字其實也不乏爭議），但其影響力遠超於此。不少人會認為，印尼華人在過去與現在不合比例的影響力，源於他們的經濟力量。的確，印尼不少首屈一指的大集團都由華人擁有，這與印尼國家歷史有關。於荷殖時代、特別是在十九世紀初，荷蘭殖民政府扶植華人、方便他們積累財富，以此作為殖民管治的權宜之計。殖民管治者的盤算是，協助華人少數族群致富，既可增加政府稅收，亦可預防華人成為殖民管治之患。一旦印尼土著變得富有，情況卻會大不相同——他們將有別於華人，會動員危及荷蘭殖民管治。事實上，增強荷蘭殖民控制力度、令華人變得富有、令印尼土著處於貧困狀態，是荷蘭人維持殖民管治超過一世紀的成功方程式。
荷蘭人分而治之的殖民遺害至今仍未被消除，印尼族群之間的互信與團結因而受削弱。印尼華人仍然需要面對印尼社會不乏種族主義色彩的敵意，他們被視為主導國家經濟、控制非由國家管理的重要經濟環節（ 例如石油與天然氣）的一群。煽動反華人情緒的印尼人其實忘記了印尼華人對印尼建國進程的貢獻。事實上，在二十世紀初，華人作家都以仍在萌芽的新興國族語言印尼語（Bahasa Indonesia）書寫。這些華人的印尼語書寫，令印尼語的應用變得成熟。換句話說，在華人的書寫協助下，印尼語始能演化成為現代語言、令人動容的國族意識與革命語言的載體，今天印尼語更是國民與同意識的重要支柱。在二戰之後的反荷殖革命，華人也有犧牲奉獻。很多從事貿易的華人從外地走私包括糧食、醫護用品、武器在內的必需品以協助印尼人對抗由荷蘭人領導的軍事行動。若然沒有華人的協助，印尼人便將難以戰勝荷蘭人、他們往後與荷蘭人談判時便難有優勢，印尼獨立或會因而無從談起。印尼獨立之後，一群華人律師奮力爭取印尼公民權利受國家憲法保障。儘管憲法主義與法治並非印尼政治傳統，但這些華人的維權努力都不應被抹殺、至今仍有影響。這些印尼華人律師更甚至曾代表華人之外的少數族群捍衛權益、力阻政府濫權與反對族群歧視，葉添興（Yap Thiam Hien）是當中的重要代表人物。
不過，印尼的政治現實是，道理往往取決於權力與力量。發生於1998 年5月、被稱為「黑色五月暴動」、令蘇哈托在同月下台的印尼排華潮便是絕佳例子。在這段混亂時期，雅加達的印尼華人被襲、他們的財產被破壞。暴動之後，印尼華人地位曾有改善，但至近年，情況再次逆轉。在2016年年底與2017年年初，激進伊斯蘭組織在繁囂的國家首都與政經中心雅加達舉行大型示威，反對華人鍾萬學（Ahok） 成為雅加達省長。 其中一場示威為印尼歷史上規模最大，參與者超過一百萬人。這些示威最終令鍾萬學在雅加達省省長選舉落敗（他在首輪選舉得票最多，但所得票數不足以令他免除第二輪選舉競爭）。
