最高檢察署特別偵查組被外界質疑「辦綠不辦藍」，存廢議題引起爭議，對此，檢察總長顏大和17日表示，民進黨才剛執政，一上台就說要廢特偵組，「是否會引起民眾對於政府肅貪決心的質疑？」並強調特偵組存廢，須由聰明、能幹、有未來性的政治家才能決定。
民意代表惡形惡狀，中央應有特別單位處理
顏大和表示，基於行政倫理，自己不能與法務部表示不同的意見，對特偵組的存與廢，各有利弊，並沒有贊不贊成，不過，顏大和指出，自己也確實質疑過特偵組存在必要性，但經過了解後，「對地方官員、民意代表惡形惡狀，地檢署應發揮功能，中央層級也應該有特別單位處理，對國家政治清明才有幫助。」
沒有「辦綠不辦藍」，誰執政就辦誰
對於外界質疑「辦綠不辦藍」，顏大和回應，肅貪的對象就是執政官員，誰執政貪污當然就辦誰，並沒有黨派問題，「例如國民黨現在是在野黨，當然就不是肅貪的對象，除非是在部會裡當首長。」
至於特偵組濫權爭議，顏大和解釋，特偵組檢察官並沒有三頭六臂，沒有因為特偵組的存在，而獲得更多的權限，特偵組檢察官跟一審檢察官一樣，沒有特別條例保護，不論羈押或搜索，都必須向法院聲請。
特偵組可「持續、專注、鎖定性」的辦案
另外，顏大和也強調特偵組與地檢署差別在於，特偵組辦案是「持續、專注、鎖定性」的辦案，可能案件量不大，但1年內只需要把少數案件辦好即可，反觀地檢署，有人力配置、時間上的限制，且特偵組可調用各地檢察事務官有21名、司法警察15名、從金管會、賦稅署徵調2名，還有行動蒐證等功能。
顏大和甚至提出TVBS民調數據，表示民眾反對廢除特偵組佔40%，贊成廢除的佔30%，加上特偵組除了辦案外，也有國際司法互助的任務，若真的裁撤後是否有專門人員可處理？顏大和強調，這些都必須納入考量特偵組存廢議題。
