訪美之行順利結束，李登輝在臺灣朝野的歡呼聲中回國，中共總書記江澤民隨後去了蘇俄訪問，兩岸當時相安無事。但是，江澤民回到北京後，卻受到了中國軍方與黨內保守派的嚴厲批判，鄧小平在幕後是否起了作用不得而知。江澤民此前曾企圖整頓貪腐而與黨內保守派起了嚴重衝突，江由於權力不穩，決定向軍方妥協，同意在臺海進行軍事演習，打擊李登輝。在此之前，中國軍方還洩密給新黨立委郁慕明，揭露李登輝與江澤民的密使交往，切斷了兩岸最高層過去5年的溝通渠道。6月16日，國臺辦發言人突然宣佈「第二次汪辜會談由於臺灣當局近期一連串毒化兩岸關係氣氛、破壞兩岸關係的行為而不能按期舉行」。
中國在歷經低調，沉默，憤怒和痛批等情緒不斷升高的一個多月後，7月13日，江澤民公開說「我曾經講過中國人不打中國人，但是我也想說明，這裡面假使國際上有一種干預的勢力，非得要進行挑起我們的衝突，這個恐怕中國人也是不能答應的。」江澤民將他即將發動飛彈演習的責任推給美國。7月18日，新華社宣布中國人民解放軍的二砲部隊將於7月21日至28日間，舉行飛彈演習，朝向距離基隆港約56公里的彭佳嶼公海海域試射，表示懲罰李登輝訪問美國。由於演習在公海，容易造成亞太各國的驚慌，對此江澤民相當擔心，在中央軍委會議上嚴厲要求軍方必須注意各國的軍事反應。
1995年7月21日至28日，中國從江西鉛山導彈基地試射東風-15短程彈道飛彈六枚，預定目標距臺灣富貴角北方約70海浬處。此次演習原定八天，但中國卻提前兩天結束，因為解放軍發射的飛彈有一顆失敗，墜落福建地區。但中國並不準備善罷干休，1995年8月15日至25日，解放軍南京軍區出動艦艇59艘、飛機192架次，在東引北方約28海浬處，進行海上攻防演練。10月31日到11月23日，解放軍在福建省東山島舉行兩棲登陸作戰操演，出動兵力包括步兵第91師、艦船63艘、飛機50架。當時正值臺灣立委選舉前夕，中共進行這一連串的演習的目的就是要造成臺灣民心不安，以壓制臺獨人士選情。1995年9月19日，海協會負責人指責「李登輝的所做所為，在言論和行動上都已公開違背了『一個中國』的原則，破壞了兩岸關係穩定發展的基礎，造成兩岸關係持續緊張和兩會商談被迫推遲，也直接損害了臺灣人民利益」。
當時被指為引發此次危機的李登輝挺住中國壓力，著手應變。他與國安高層研判，中國的飛彈演習有依據國際慣例事先宣佈，因而排除對臺灣突擊要件，並不對臺灣的安全構成立即威脅，但該演習明顯具有政治目的，因此，應對方案為對內安定民心，對外争取美日重視。演習開始後，臺灣朝野一致譴責中國。8月10日，在中國宣佈第二波演習後，李登輝約見行政院長連戰，會後，行政院推出多項應變措施，企圖穩定股市和經濟。10月9日，李登輝指示國安會秘書長丁懋時提前就次年總統大選組成「應變小組」，及早就臺海情勢進行準備。中國的演習雖然對臺灣的股市匯市有短暫打擊，但也造成臺灣人民對中國的反感驟升，並未對立委選舉結果帶來實質影響。
