課程設置分為軍事和政治兩大類，與廣州同時期的黃埔本校一樣。按《國民革命軍中央軍事政治學校潮州分校第二期學生軍事政治教育綱領表》之規定，潮州分校學生所學習之課程，學時為六個星期。學生課程分為軍事、政治兩大類。軍事方面，分為學科和術科。軍事學科課程包括《圖上戰與實施》、《野外戰與實施》、《兵棋作業》、《沙盤演習》、《軍制》、《兵器》、《地形》、《築壘》、《交通》、《軍隊教育》及《衛生學》。軍事術科課程包括《步兵教練》、《射擊》、《陣中勤務》、《技術》、《特種武器操法》及《野營演習》。可以說，涉及到通常軍事教育的專業課程，潮州分校是門類完整、設置立體。
學生政治課程包括了《三民主義》、《建國方略》、《建國大綱》、《中國國民黨第一次全國代表大會宣言》、《帝國主義侵略中國史》、《世界革命史》、《政治學概論》、《經濟學概論》、《社會科學概論》、《社會主義》、《黨的組織問題》、《軍隊政治工作》、《特別演講》。從政治課程設置上可以看到，當時的潮州分校非常嚴格和準確在貫徹「政治建軍」、「主義建軍」的精神戰力教育，階級革命與左翼化的色彩非常濃厚。
潮州分校總共開辦了2期，第一期畢業學員348名，第二期畢業學員380名。畢業生離開校園即投身到國民革命的軍事洪流中。不過，與東征、北伐、抗日的國軍歷史一樣，只要是現代中國歷史上「光榮而偉大」的好事情，大家都覺得自己的功勞不能被忘掉。於是乎，關於黃埔軍校潮州分校的誕生，在中國大陸方面和中共黨史中，有另一種解讀：在紅色共產革命史觀中，固然不否認蔣中正是黃埔校長，也不否認何應欽負責籌辦黃埔潮州分校；但共產革命史觀認為，潮州分校之所以能夠誕生，最重要的靈魂人物是周恩來；蓋因周恩來在國軍東征勝利後，擔任東江行署專員，何應欽是潮梅善後督辦，二人可謂執掌粵東潮州、汕頭、梅州一帶的行政大權。辦軍校不光是軍隊的事，還要有地方配合，所以怎麼能忽略行署專員呢？況且，周恩來還是東征軍的總政治部主任，潮州分校的8位政治教官中，有2位是著名的共產黨人蕭楚女、惲代英。所以，黃埔潮州分校誕生，在中國大陸被視為是「國共合作」的產物。
軍事人才輩出 名人亦不少
很多人探討黃埔歷史時，只把本校誕生的名將看作是黃埔光環的產物。但實際上，包括潮州分校在內，有名的教職員、軍校生絕對不少，有些成為了國軍楷模，有些成為了國軍大官，有些則見證了時代滄桑。
今天的高雄鳳山陸軍官校學生宿舍樓，多以國軍先烈之名加冠。其中之奇樓是非常引人注目的宿舍建築。之奇樓是為了紀念國軍名將戴之奇而命名。戴之奇就畢業於黃埔潮州分校。他參加北伐、剿共、抗戰。特別是在抗戰中，先後參與淞滬會戰、南京保衛戰，是蔣中正非常信賴的國軍將領。曾擔任過最為效忠中華民國的國軍青年軍第201師師長。國共內戰時期，最終在蘇北戰場上自戕成仁。國軍第六十六軍一五九師四七七旅副旅長黃紀福陣亡於抗戰時期的南京保衛戰；浙江金華警備區副指揮官程嘯平在1941年的紹興阻擊戰中抗擊日軍陣亡；台州守備指揮部司令蔣志英在1941年5月抗擊日軍進攻犧牲於海門。他們都是潮州分校的國軍楷模。
