官員表示，如果《宗教基本法》真的通過，內政部對於宗教團體的財務監理，等於是維持目前《監督寺廟條例》的狀態。
《宗教基本法》的金鐘罩，不僅將保障宗教財團法人免於財務揭露，目前宗教團體不斷增生的周邊公益組織，例如社團法人、公益信託，未來恐怕也很難監督。
公益信託免受財務監督，宗教法人恐成「善霸」
以公益信託為例，目前成立公益信託的宗教團體，包括一貫道的「明音宗教公益信託」，基督教團體的「基督教中華信望愛基金」，佛光山的「星雲大師教育基金」，目前極力推動《公益信託專法》的立委王榮璋，日前就曾在立法院質疑，相關部會對於宗教團體捐助成立之公益信託，缺乏財務監督機制。
據了解，法務部目前研議的《信託法》修法，已經準備針對信託捐贈行為，有更嚴格的規定，例如，限制股票捐贈之比率等等；不過，相關單位都擔心，未來宗教團體可能透過遊說，再度將宗教公益信託，排除在《信託法》的規範之外。
尤其是，立委提案的《宗教基本法》草案，同時針對宗教法人之稅捐、興辦公益等事業訂定特殊待遇，在缺乏相關財務監督機制下，宗教法人未來恐將成為政大地政系教授徐世榮所形容的「善霸」。
該草案規定，宗教法人或其他宗教團體相關稅捐之減免，準用稅法有關財團法人之標準，同時也準備放寬宗教團體，兼營墓地、火化場及骨灰（骸）存放設施等事業。
內政部憂宗教團體稅捐措施 讓加強財務揭露目的受阻
內政部官員表示，內政部從1990年代起，輔導宗教團體合法經營，針對非法佔用國有土地之宗教團體，當初同意「合法化」的前提，是宗教團體須成立財團法人，這樣的設計，是希望財團法人日後解散後，財產回歸地方政府。
「當初財政部之所以同意宗教團體，豁免遺贈稅、地價稅、房屋稅、營業稅等措施，目的都是希望宗教團體能夠加強財務揭露，現在立委提案訂定《宗教基本法》，賦予宗教團體免受財務監督之權利，內政部方面很擔心，財政部可能會收回上述賦稅優惠。」
另外，針對《宗教基本法》草案，將納骨塔納入宗教建築之附屬設施，內政部官員表示，目前《殯葬管理條例》，原本就針對寺廟既有之靈骨塔設施，允許繼續原地使用，但殯葬設施之申設，涉及到土地使用分區，宗教用地與殯葬用地二者並不相容，不能混用，內政部面對其他壓力團體，現階段要放寬寺廟兼營殯葬設施有其困難。
