前內政部長李鴻源接受媒體專訪，爆出當年離職的原因，源於與時任行政院長江宜樺之間的「心結」。李鴻源說，外界普遍認為，他丟官內政部長的主因是由於台北市前市長郝龍斌向前總統馬英九報告，說他「抵制世大運」。但李鴻源自爆，真正的原因是，他向行政院請示求援，但因江宜樺當時可能擔心「我會搶他飯碗」，遭江宜樺壓公文3個月，才是他去職的主因。
李鴻源接受《蘋果日報》專訪時，披露出過去與長官江宜樺不合的秘辛，他表示，江宜樺故意壓住「世大運選手村是否建於林口」的公文3個月，讓他在沒有批示的情況下進退兩難，由於郝龍斌向馬英九報告說他阻擋世大運舉辦，終於因為背上「抵制世大運」罪名丟官。他也說，江宜樺始終擔心他會搶走「行政院長」飯碗，勾出兩人心結。對於李鴻源的說詞，親近江宜樺的友人表示「沒有回應」。
選手村一案—江宜樺不批示、立法院不允許、總統府又格外關心
李鴻源當時質疑，當初郝龍斌主張將選手村蓋在林口，利用林口國宅用地與3、40億的國宅基金蓋選手村，再轉換為合宜住宅，有違《國有財產法》，而且要硬塞3000位選手，可能會癱瘓林口交通，因此建議另尋他地蓋村，況且，當時立院內政委員會也決議不能動用國宅基金，所以他報呈公文向江宜樺請示。
但是，江宜樺就是不批，壓了3個月公文，郝龍斌又因蓋村心切，幾乎天天撥電馬英九抱怨，馬英九因此格外關注世大運，認為「李鴻源很麻煩」。李鴻源大吐苦水表示，總統府壓力俱增，但直屬長官江宜樺卻遲不肯批，立法院也堅決不準動用國宅基金，他卡在總統府與兩院之間動彈不得，導致最後離開時的罪名，就是「抵制世大運」。
李鴻源痛批，世大運一事，成為別人打擊他的手段。他說，他因尊重行政倫理，從不越級報告，造成「我講1句，人家講10句」，最後變成離開政壇的致命傷。離職後，李鴻源屢屢針對林口選手村發言，也對於牽涉土壤液化的防災型都更，出言抱怨江宜樺，可見2人結怨之深。
院方要求轉任政務委員 堅持拔掉內政部長
回首檢視李鴻源的卸任過程：2014年2月傳出馬英九與江宜樺「建議」李鴻源改任政務委員，時任行政院發言人的孫立群說，馬與江認為，李鴻源的專業主張，如水患綜合治理、活化公有土地等，皆屬跨部會性質，較適合以政務委員身份推動。但李鴻源當時即明確表示，台大教職借調期滿，若政府希望他留任內政部長，他願意辭去教職，但若要他接任政務委員，他寧願返校教書。
2014年2月25日，驚爆李鴻源確定去職。隔日，行政院聲明，希望能再考慮接任政務委員。通常，面對部會首長離職，除非是重大咎責，不然院長都會予以慰留；但李鴻源的離職案例，卻見院方並非慰留其「內政部長」職，而是希望他考慮接任「政務委員」，拔除部長職位意味濃厚。李鴻源最終重返台大執教。
